Kenshin Himura (Battosai l'assassin) est toujours accompagner par Kaoru Kamia, Yahiko Myôjin, Sanosuké Sagara.
Kenshin Himura, le héros du manga, porte un sabre dont la lame est inversée, ce qui interdit de tuer. Son pseudonyme est Battosai Himura, le plus célèbre assassin de tous les patriotes qui ont contribué a la restauration de l'ère Meiji. Après l'avènement de Meiji, Kenshin est devenu un vagabond. Cependant, il loge temporairement au Dôjô Kamiya , après avoir mis en déroute les frères Hiruma et résolu ainsi "l'affaire du faux Battosai". Au cours de cette histoire, le Dôjô Kamiya a perdu tout ses disciples mais depuis l'arrivée de Yahiko Myôjin, un jeune issu de la caste des samouraïs, sauvé des Yakuza par Kenshin, le Dôjô peut espérer renaître. Malheureusement, sitôt sortis de prison, les frères Hiruma tentent de nouveau d'obtenir le terrain du Dôjô. Ils engagent Sanosuké Sagara, une sorte de mercenaire, pour se débarrasser de Kenshin. Malgré ses réticences, Sanosuké accepte la mission en raison de sa haine pour les anciens patriotes. Kenshin relève le défi contre son gré. Le combat se déroule en présence de Kaoru, da Yahiko et des frères Hiruma...